All modules for which code is available

• sc_tools.bm.integration
• sc_tools.bm.mask_io
• sc_tools.bm.segment
• sc_tools.bm.segmentation
• sc_tools.ingest.config
• sc_tools.ingest.loaders
• sc_tools.ingest.slurm
• sc_tools.memory.gpu
• sc_tools.memory.profiling
• sc_tools.pipeline
• sc_tools.pl.gsea
• sc_tools.pl.heatmaps
• sc_tools.pl.save
• sc_tools.pl.spatial
• sc_tools.pp.integrate
• sc_tools.pp.normalize
• sc_tools.pp.recipes
• sc_tools.pp.reduce
• sc_tools.qc.metrics
• sc_tools.qc.plots
• sc_tools.qc.report
• sc_tools.qc.sample_qc
• sc_tools.qc.spatial
• sc_tools.registry
• sc_tools.storage
• sc_tools.tl.colocalization
• sc_tools.tl.deconvolution
• sc_tools.tl.gene_sets
• sc_tools.tl.gsea
• sc_tools.tl.score_signature
• sc_tools.utils.save
• sc_tools.utils.signatures
• sc_tools.validate